Team: Beerten1 (Stijn Beerten)
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 35 |
| Fabio | ARU | Team Qhubeka ASSOS | 10 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 28 |
| Edvald | BOASSON HAGEN | Decathlon AG2R La Mondiale Team | 23 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 35 |
| Pierre | ROLLAND | B&B Hotels-Vital Concept | 5 |
| Thibaut | PINOT | Groupama - FDJ | 10 |
| John | DEGENKOLB | Team dsm-firmenich PostNL | 3 |
| Joaquim | RODRIGUEZ | Onbekend | 1 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 39 |
| Alberto | CONTADOR | Lidl - Trek | 27 |
| Mikel | LANDA | Soudal - Quick Step | 0 |
| Bauke | MOLLEMA | Lidl - Trek | 8 |
Etappe 1: Les Gets - Les Gets 05-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 4 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 9 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 6 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 8 |
| Alberto | CONTADOR | Lidl - Trek | 10 |
Etappe 2: Cluses - Saint Vulbas 06-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Edvald | BOASSON HAGEN | Decathlon AG2R La Mondiale Team | 7 |
Etappe 3: Crêches-sur-Saône - Chalmazel - Jeansagnière 07-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Joaquim | RODRIGUEZ | Onbekend | 1 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 3 |
| Bauke | MOLLEMA | Lidl - Trek | 5 |
Etappe 4: Boën-sur-Lignon - Tournon-sur-Rhône 08-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Fabio | ARU | Team Qhubeka ASSOS | 10 |
| Edvald | BOASSON HAGEN | Decathlon AG2R La Mondiale Team | 6 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 7 |
Etappe 5: Tain-l'Hermitage - Belley 09-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Edvald | BOASSON HAGEN | Decathlon AG2R La Mondiale Team | 10 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 9 |
| John | DEGENKOLB | Team dsm-firmenich PostNL | 3 |
Etappe 6: La Ravoire - Vaujany 10-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 5 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 9 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 1 |
| Pierre | ROLLAND | B&B Hotels-Vital Concept | 4 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 10 |
| Alberto | CONTADOR | Lidl - Trek | 6 |
| Bauke | MOLLEMA | Lidl - Trek | 3 |
Etappe 7: La Rochette - Méribel 11-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 9 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 1 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 2 |
| Thibaut | PINOT | Groupama - FDJ | 10 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 7 |
| Alberto | CONTADOR | Lidl - Trek | 5 |
Eindklassement 12-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 9 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 7 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 5 |
| Pierre | ROLLAND | B&B Hotels-Vital Concept | 1 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 10 |
| Alberto | CONTADOR | Lidl - Trek | 6 |
Etappe 9: Le Pont-de-Claix - Superdévoluy 12-06-2016
| Voornaam | Achternaam | Team | Punten |
| Romain | BARDET | Team dsm-firmenich PostNL | 8 |
| Richie | PORTE | INEOS Grenadiers | 2 |
| Julian | ALAPHILIPPE | Tudor Pro Cycling Team | 5 |
| Christopher | FROOME | Israel Premier Tech | 1 |